Santa Run est un jeu de course sans fin sur le thème de Noël. Le joueur dirige une version chibi du Père Noël en l`éloignant de la circulation, des obstacles et des menaces pendant qu`il court dans une rue enneigée et sur des voies ferrées pour collecter des sucres d`orge et d`autres objets. Le Père Noël doit également se lancer à la poursuite d`un raton laveur voleur qui a dérobé une grande quantité d`or dans le transit qui avait été mis de côté pour célébrer les fêtes de fin d`année. Le but du joueur est de ramasser des objets utiles pour débloquer de nouvelles zones du jeu et faire courir le Père Noël le plus longtemps possible.
Comme dans les autres jeux de course de type tableau de bord, la course commence au moment où le joueur interagit avec l`écran. Il doit éloigner le Père Noël des boules de neige géantes et le faire passer par-dessus ou par-dessous des barrières de construction jaunes et noires. Le jeu comporte également des trains stationnés et en mouvement que le joueur doit diriger pour que le Père Noël les contourne ou les traverse afin d`éviter les dommages et de récupérer des objets. Si le Père Noël entre en contact avec un objet dangereux, le joueur peut continuer en regardant une publicité ou en recommençant.
Santa Run propose également un tournoi. Le joueur peut suivre les meilleurs scores en sélectionnant un bouton marqué d`un trophée sur l`écran d`accueil.