Minigolf Archipelago est un jeu d`adresse qui se concentre sur le hobby et le sport du mini-golf. Le terme "archipel" fait référence à un groupe d`îles. Chaque parcours clos, en damier vert dégradé, flotte sur un fond bleu. Le jeu affiche une ou plusieurs de ces îles par niveau. Le but du joueur est de placer ses boules dans les trous marqués par des drapeaux blancs ou rouges. Il doit également essayer de rester à l`écart des trous marqués de drapeaux noirs qui représentent des zones où des voleurs tentent de dérober des boules.
Le joueur utilise une flèche blanche à l`écran et sa souris, son trackpad ou son écran tactile pour diriger une boule. Il peut effectuer des tirs rectilignes et ininterrompus, ainsi que des tirs sur les murs latéraux. Le jeu fournit également des obstacles physiques utiles, tels que des triangles, des cercles et d`autres formes géométriques, que le joueur peut utiliser pour diriger une balle.
Minigolf Archipelago fournit également des outils. Lorsque le joueur se trouve sur un parcours à drapeaux multiples qui comporte des drapeaux blancs et rouges, il peut utiliser le trou du drapeau blanc comme point de contrôle. Lorsque la balle réapparaît pour lui permettre d`effectuer le coup suivant, elle apparaît à l`emplacement du drapeau blanc précédent plutôt qu`à la position de départ. En outre, certains parcours comportent des trous de téléportation bleus-violets qui permettent au joueur de placer une balle dans un trou avec un drapeau rouge sur une île en tirant la balle depuis une île complètement différente.
Si le joueur regarde les publicités, il peut gagner des boules de feu ou sauter un niveau ou un trou avec drapeau noir.