Jewel Bubbles 3 est un jeu de correspondance qui présente des bijoux futuristes ressemblant à des bulles transparentes remplies de liquide coloré tourbillonnant. Le jeu suit les règles classiques du match-3. Le joueur intervertit deux joyaux pour créer des lignes d`au moins trois joyaux identiques. Le jeu retire la ligne du terrain de jeu et de nouvelles lignes tombent et se glissent dans les espaces libres.
Le jeu offre 60 niveaux de jeu classique.
Le jeu offre 60 niveaux de jeu classique. Il existe également une option de jeu bonus verrouillée. Le joueur reçoit des points et des étoiles pour ses performances à chaque niveau. Il ne réussit que s`il accomplit les tâches qui lui sont confiées. Par exemple, il peut devoir effectuer un nombre spécifique de tours valides pour gagner un certain nombre de points, supprimer les blocs gris derrière les joyaux, ou faire disparaître le plus grand nombre de joyaux du champ avant qu`un sablier ne s`épuise.
Jewel Bubbles 3 propose également des boosters classiques que le jeu appelle des bombes. Si le joueur complète des lignes d`au moins quatre joyaux identiques, il reçoit différentes versions de ces puissants outils, notamment un joyau en forme de diamant à l`intérieur d`une bulle qui élimine une ligne et une colonne en même temps, un centre de points tourbillonnant qui élimine un rectangle de six joyaux ou un carré de neuf joyaux, et un tourbillon arc-en-ciel qui élimine tous les joyaux de la même couleur que celui avec lequel le joueur l`échange sur le terrain.
Si le joueur n`arrive pas à se décider, il peut utiliser le bouton représentant un joyau dans le coin inférieur gauche pour révéler une correspondance.