Minigolf Archipelago er et færdighedsspil, der fokuserer på minigolf som hobby og sport. Udtrykket "archipelago" henviser til en gruppering af øer. Hver lukket, gradientgrøn skakbrætbane flyder på en blå baggrund. Spillet viser en eller flere af disse øer pr. niveau. Spillerens mål er at putte sine bolde i de huller, der er markeret med hvide eller røde flag. De skal også forsøge at holde sig væk fra huller markeret med sorte flag, som repræsenterer områder, hvor tyve forsøger at stjæle kugler.
Spilleren bruger en hvid pil på skærmen og sin mus, trackpad eller touchscreen til at styre en kugle. De kan lave lige, uafbrudte skud og bankeskud fra sidevæggene. Spillet leverer også nyttige fysiske forhindringer, såsom trekanter, cirkler og andre geometriske former, som spilleren kan bruge til at styre bolden med.
Minigolf Archipelago leverer også værktøjer. Når spilleren er på en multi-flag bane med hvide og røde flag, kan de bruge hullet med det hvide flag som et checkpoint. Når bolden dukker op igen, så man kan slå det næste slag, dukker den op på det sted, hvor det forrige hvide flag var, i stedet for på startpositionen. Derudover har nogle baner blålilla teleporteringshuller, som giver spilleren mulighed for at putte en bold i et hul med et rødt flag på en ø ved at skyde bolden fra en helt anden ø.
Hvis spilleren ser reklamer, kan de tjene ildkugler eller springe et niveau eller et hul med sort flag over.