Gem Twins er et færdighedspuslespil med klassisk pixeleret arkadegrafik. To brødre er på jagt efter eventyr og svævende plantepærer på tværs af 27 etaper (niveauer) af underjordiske rum. Brødrene er ikke helt normale. De kan forvandle sig til ædelstene. Denne gave er gavnlig. Det gør det lettere for dem at få adgang til vanskelige områder og omgå fælder og forhindringer. Spillerens mål er at styre deres handlinger for at nå hver pæres mål i almindelig og speedrun-tilstand.
Spilleren kan styre hver af tvillingerne til at gå og hoppe. De kan også få en bror ad gangen til midlertidigt at fryse på plads på jorden eller i luften. Med denne evne kan de skabe en smal platform med den ene bror og derefter få den anden til at bruge stedet som et springpunkt, når de skal håndtere høje vægge, etager og andre forhindringer. Da de kan fastfryse en bror midt i et spring, kan de skabe denne ædelstensplatform over jordoverfladen. De kan skabe den på et eller flere punkter midt på siden af en mur.
