Bubble Shooter Pop It Now er et sjovt match-3-spil, hvor du kan lave bobler og poppe bobler, og det er et eventyrligt og magisk tema. Som i andre versioner af det klassiske Bubble Shooter skyder spilleren et farvet projektil mod to eller flere forbundne, matchende bobler på rækkerne øverst på spillepladen for at fjerne dem fra banen. Når boblerne falder til bunden af feltet, springer de og giver spilleren point.
I modsætning til lignende spil giver Bubble Shooter Pop It Now spilleren mulighed for at vælge en hovedperson, som sammen med et kæledyr motiverer og vejleder ham. I stedet for en pilbaseret, armbrøst- eller kanonskyder med én projektilboble har spillet en sølvring med to bobler, så spilleren kan skifte mellem projektilerne for at vælge den, der passer bedst til de tilgængelige bobler. Spilleren kan også skyde et projektil over toppen af spillefeltet, hvis der er et hul, hvilket så nogle gange fører til, at en masse skjulte bobler fjernes.
Selv om der med få sekunders mellemrum kommer nye rækker øverst på spillefeltet, som skubber de allerede eksisterende rækker længere ned på skærmen, kan spilleren bruge boostere til at hjælpe dem med at rydde feltet hurtigere. De får adgang til en Freeze Field Booster, der forhindrer boblerne i at falde ned, en Magic Bubble Booster, der ændrer projektilets farve, og en Bomb Bubble Booster, der ødelægger de bobler, den rører ved.