Water Sort är ett sorteringsspel i underkategorin vätskesortering. Spelaren sorterar band av färgat vatten i kolvar tills varje behållare bara innehåller en färg. Deras mål är att låsa upp nya nivåer och tjäna prestationstitlar och belöningar.
Spelaren kan granska de potentiella prestationerna via listknappen längst ned till vänster. Titlarna är bland annat Rookie, Blazer, Captain, Expert, Adventurer, Pioneer, Conqueror, Master, King och Legend. Listan gör det också möjligt att samla myntbelöningar efter att ha nått varje mål. Vanliga prestationer är att klara ett visst antal nivåer och att utföra vissa handlingar ett visst antal gånger.
Water Sort är inte ett alltför svårt spel, så länge spelaren planerar sina drag flera steg framåt. För att överföra vatten från en flaska till en annan behöver man bara välja hällbehållare och sedan uppsamlingsbehållare. En vätska kan bara hällas i en lucka ovanpå en färgmatchande vätska eller en tom behållare. Om det inte finns tillräckligt med utrymme i en lucka delar spelet automatiskt på vattnet. Samma vatten i toppen av två flaskor kan ibland leda till att spelaren får slut på drag.
Spelet försöker hjälpa spelaren via flera booster-liknande verktyg. Spelaren kan använda dubbla pilar för att återställa nivån, en pip för att komma åt ett färgat band från botten av en kolv, en böjd bakåtpil för att vända det senaste draget och en kolvknapp för att lägga till en delvis eller helt tom behållare till fältet.