Thread Sort Puzzle 3D är ett sorteringspussel med föremål som är gjorda av trådar. Spelarens mål är att plocka isär dessa föremål genom att dra i, nysta upp och sortera trådar i färgmatchade lådor. Detta spel matchar närmast populära spik-, knappnåls-, skruv- och andra hårdvarusorteringsspel som Screw It!, Get a Screw: Pussel! och Färger Pins.
När spelaren har valt en färgad tråd drar spelet automatiskt ut tråden från föremålet och lindar den runt en spole i en behållare. Om färgen inte matchar spolas tråden upp i fem hål under behållarna. Om spelaren fyller den femte spolen förlorar han. De måste då se en annons för att fortsätta eller starta om nivån.
Annars fortsätter spelaren denna process tills det inte finns några fler trådar kvar. Spelet belönar dem med mynt och låser sedan upp nästa nivå och objekt. När som helst kan de zooma in på ett objekt genom att använda ett zoomreglage i nedre högra hörnet.
Thread Sort Puzzle 3D låter spelaren arbeta snabbare genom att låsa upp ytterligare två behållare när de tittar på videor. Det ger dem också tre boosters. Spelaren kan lägga till ett hål, förvandla en låda för att acceptera valfri färg och rensa trådarna från alla hål.
