Pop Puzzle är ett sorteringsspel med en poppande komponent. I ett stort hav måste spelaren sortera och poppa färgglada skivor som presenteras på vita pelare i staplar med blandade färger. De måste poppa alla skivor innan de har slut på drag.
Spelet visar antalet drag i det övre mittområdet ovanför havet. Staplarna är olika för varje nivå. På en nivå kanske spelaren bara behöver sortera två färger över två staplar. På en annan nivå kan de behöva stapla sex eller fler färger över tre eller fler staplar.
Spelaren skapar minihögar som innehåller tre eller fler matchande skivor. Ibland orsakar kraften från poppningen en kedjereaktion. Till exempel, när tre matchande skivor poppar i en stapel, kan en eller flera färgmatchande skivor högst upp i en annan stapel också poppa. Om spelaren poppar en ministapel som har icke-matchande skivor överst, kan dessutom en eller flera skivor som faller genom gapet på matchande lägre skivor också poppa.
Pop Puzzles regler är inte skrivna i sten. Poppingkraften och eventuella efterföljande kedjereaktioner kan få slumpmässiga skivor i vilken stapel som helst att poppa på plats. Även om en kedjereaktion misslyckas med att poppa skivor erbjuder spelet tre verktyg för att göra poppningen enklare.
Under pelarna kan spelaren använda alternativen shuffle, bomb och hint om de tittar på reklam. De kan också använda annonsvisningar för att fortsätta med fem ytterligare drag varje gång de tar slut och misslyckas med en nivå.
