Merge Combo är ett merge-spel i 2048-stil som erbjuder unika sorterings- och andra element. I ett rum med ljusblå väggar och trägolv sorterar spelaren staplar av numrerade färgade block för att slå samman matchande block och skapa block med nästa högre nummer. De försöker också tjäna en hög poäng innan de tar slut på drag.
Spelet visar nivånumret ovanför en förloppsindikator i det övre vänstra området och spelarens aktuella poäng i det övre högra området. Spelaren kan öka sin poäng när som helst genom att visa en annons.
Till skillnad från många sorteringsspel tillåter Merge Combo spelaren att placera ett block ovanpå ett icke-matchande block för att exponera ett eller flera block som behövs för sammanslagningar. Det gör sortering svårare nivå till nivå genom att lägga till block till de återstående från föregående nivå.
När spelaren sammanfogar två eller flera matchande block försvinner dessa block och ett nytt block visas markerat med nästa nummer. Till exempel slås två 2-block samman för att bli ett 3-block.
Om en stapel har ett block med nästa nummer direkt under ett av blocken i ett par, slås det nya blocket automatiskt samman med det för att skapa ett nytt block med nästa högre nummer. Detta är ett "combo"-drag. Spelaren tar sig snabbare genom en nivå och får fler poäng när han eller hon utför kombinationer.