Math Gardens är ett talpussel och renoveringsspel. En stadstjej som heter Emily behöver spelarens hjälp med att städa och renovera ett tak för att skapa en urban trädgård. Spelaren utför varje renovering efter att de tjänat tillräckligt med stjärnor genom att lösa matematiska ekvationer.
Under matematikspelet får spelaren två eller flera överlappande matematiska ekvationer i en layout som liknar kolumnerna och raderna i ett korsord. Spelet visar numrerade brickor under ekvationsområdet. Spelaren måste placera dessa brickor i rätt positioner för att slutföra ekvationerna. När de har avslutat en nivå får de en stjärna.
Math Gardens uppmanar så småningom spelaren att välja en blomkruka i det nedre vänstra hörnet på stadsskärmen och köpa en renoveringstjänst med en eller flera stjärnor. Den utför sedan automatiserade renoveringsåtgärder, till exempel att rensa bort skräp och stående vatten från taket, plantera vinstockar och andra grönska och blommor och bygga en trädgårdsväg.
Om spelaren fastnar när han försöker lösa ekvationer kan han använda ädelstenar som han vinner i slutet av varje nivå för att betala för hjälpverktyg. Förstoringsglaset visar ett enda tal. Bullseye-knappen avslöjar en hel ekvation.
Varje dag uppmanar spelet också spelaren att uppnå olika mål, vilket visas när spelaren väljer en gyllene blomformad tätningsknapp ovanför blomkrukan. När de slutför alla mål för en dag får de belöningar i skattkistan.
Spelaren kan också utföra månatliga uppdrag. De väljer en checklisteknapp i det övre vänstra hörnet och spelar sedan dagliga matematiska ekvationsspel för att tjäna en månatlig belöning.
