Jelly Run 2048 är ett dash racing pussel spel. Spelaren styr färgglada, numrerade kuber för att utföra parkour- och löparstilrörelser med endast vänster och höger kontrollrörelser under nivåer och oändligt spel.
Spelaren kontrollerar inte bara ett block. De kan ansluta och koppla bort sammanslagna kuber för att tjäna olika syften under loppet. De sammanfogar matchande kuber för att skapa högre numrerade kuber som klassiska 2048. Dessutom samlar de ädelstenar medan de kringgår hinder. De tjänar ytterligare ädelstenar när de låser upp nya nivåer.
Jelly Run 2048 som en kublöpare erbjuder mycket action och hinder. Spelaren kan dela en kub i hälften i två lika stora kuber och sedan slå samman kuberna med matchande kuber eller absorbera kuber med lägre nummer. De kan sedan slå samman de två kuberna för att skapa en högre numrerad kub.
Med enkla och delade kuber kan spelaren också skjuta icke-matchande kuber med högre nummer i nya riktningar ur vägen eller genom hinder. De kan använda racerbanestrukturer som delade banor och ramper för att kringgå spikförsedda roterande pelare och hjul, svängande yxor, röda reduktionsgrindar och andra hinder och hot. Dessutom kan de samla nycklar för att låsa upp dörrar och använda gröna grindar för att multiplicera kubvärden.
Spelet erbjuder också flera bonusrundor och sidospelupplevelser. Till exempel kan spelaren välja bygg- och gruvalternativ.