Hexa Sort Master är ett logiskt pusselspel i blockstil som innehåller sorteringsuppgifter på olika nivåer. Mot en blå bakgrund sorterar spelaren staplar av hexagonformade brickor i olika färger ovanpå rutnät av gråa stenar i olika mönster. Deras mål är att slutföra poänguppgifter, tjäna mynt och avsluta uppdrag.
Spelet kräver att spelaren sorterar tre staplar åt gången baserat på färg och en ikon som är tryckt på toppen av varje kakel. Kakelikonerna är moln, droppar, flammor, nycklar, dödskallar, stjärnor och svärd. Spelaren kan bara använda tomma ytor för sortering. De får poäng när de har lyckats sortera brickorna i tillräckligt höga staplar.
Spelaren sorterar genom att skjuta en stapel på ett tomt fält och sedan skjuta en annan stapel med en matchande toppfärg och ikon bredvid den. Spelet vänder automatiskt den matchande delen av den första stapeln till den andra. Om färgade brickor i den nedre, otäckta delen av stapeln matchar någon intilliggande stapel, vänds dessa brickor också automatiskt till en ny position.
Om spelaren får slut på utrymme ger Hexa Sort Master dem tillgång till stapelborttagning, omplacering och blandningsförstärkare. Med sina myntvinster kan de köpa fler boosters över tiden.
I slutet av en nivå kan spelaren se en annonsvideo för att få extra mynt. De får också mynt, hjärtliv, oändliga hjärtliv eller boosters via dagliga gåvor när de använder en kalenderikon på startskärmen. Om spelaren uppnår vissa mål får han eller hon ytterligare belöningar i popup-fönstret för uppdrag som nås via en scroll-ikon på samma skärm.
