Flagga Pussel Jam: Collect Flags är ett pedagogiskt pusselspel med ett match-3-sorteringselement. Spelaren väljer smala tygremsor i uppsättningar om tre för att skapa flaggor. I slutet av varje nivå får de namnet på det land som representeras av en flagga och guldmyntbelöningar.
Spelet äger rum på en träbordsskiva med utskurna sektioner. I mitten av spelplanen får spelaren rullade och avrullade tygremsor i ett eller flera lager i en sektion. De måste välja remsorna i rätt ordning för att matcha en eller flera flaggor som presenteras som bleka bilder i sektioner nära toppen av bordet.
Flagga Puzzle Jam: Collect Flags ger spelaren flera metoder som gör det lättare att sortera dessa remsor. De får tomma fack som är utformade för att hålla rullade remsor. De använder dessa platser som fria celler när de behöver ta bort en eller flera remsor för att avslöja delvis dolda bitar. De får inledningsvis tre platser. På nivåerna 10, 15, 21 och 28 låser spelet upp ytterligare sådana.
Spelaren får tillgång till booster-liknande verktyg under mittområdet som inkluderar knappar för omladdning av nivå, ångra sista draget och blanda. De betalar för åtkomst med myntbelöningarna. De kan dubbla sina belöningar i slutet av varje nivå genom att titta på videor.