Cubica är ett blockmatchningsspel som innehåller element från populära match-3- och kakelmatchningsspel med några viktiga skillnader. Mot fantastiska bakgrunder visas ett eller flera brädor per nivå som innehåller en blandning av färg- och mönstermatchade kuber. Spelarens mål är att poppa minst två istället för tre kuber för att slutföra föremålssamlingsmål som visas på en vertikal panel på vänster sida. Vanliga föremål är ädelstenar, trälådor, musiknoter från högtalare och bubblor. Spelaren måste också låsa upp nya nivåer, tjäna mynt och samla belöningar.
Spelaren kan skapa specialföremål som också poppar kuber och samlar in basföremål. De använder mönstren på kuberna för att styra sina handlingar. Specialföremål är särskilt användbara när de måste hantera kuberna som flyttar sig i onormala riktningar åt vänster, höger och uppåt.
När spelaren till exempel väljer intilliggande kuber som har explosionsikoner, sammanfogas bitarna vid valpunkten för att bilda en lindad pinndynamitbomb. När de väljer kuber markerade med bollar bildar de en discokula som slår färgmatchade kuber med elektricitet. Om de kombinerar två intilliggande specialföremål skapar de en supereffekt, till exempel att placera bomber i alla enfärgade positioner genom att kombinera en bomb med en discokula.
Cubica erbjuder också fem låsta boosters på en vertikal panel på höger sida. Med tiden får spelaren tillgång till en hammare som rensar ett objekt, raketer som rensar rader och kolumner, en tärning från ett tärningsset som blandar alla bitar och en pensel som ändrar färgen på alla enfärgade kuber.
Spelet erbjuder olika andra roliga distraktioner som belönar spelaren med extra mynt och boosters. Spelaren kan spela bonusnivåer, ändra bakgrundsbilden på hemskärmen efter att ha vunnit ett visst antal nivåer och delta i specialevenemang och minispel.