Bubble Dropper är ett bubbelspel som har en unik spelmetod. Istället för att ha en klassisk layout med en pekare som skjuter mot bubblor som hänger i rader, har den ett toppcentrerat hål som släpper färgglada standard- och power booster-bubblor på en central stolpe som roterar som ett hjul.
Spelaren riktar inte in sig på och skjuter bubblorna på hjulet. De letar efter match-3- och booster-möjligheter och vrider sedan på hjulet genom att göra vänster- och högerglidande rörelser på en horisontell kedja längs botten av skärmen. Dessa rörelser får två dolda figurer att flytta kedjan med manuella handvinschar. Spelarens mål är att ta bort alla bubblor från stolpen och få de högsta bas- och tidsbonuspoängen över 100 nivåer.
Bubble Dropper ställer spelaren inför många olika hinder, till exempel is som döljer bubblornas färger och solida stenar som inte går att ta sig igenom. Även om kraftbubblor hjälper till att lösa några av dessa utmaningar, genereras inte boosters av spelarens handlingar eller erbjuds som separata alternativ.
Spelet släpper slumpmässigt kraftbubblor från samma hål som de standardfärgade bubblorna. Vanliga krafter inkluderar flammor som bränner bort kluster av blandade bubblor, blixtar som tar bort alla färgmatchade bubblor, portaler som drar en eller flera bubblor i valfri färg bort från spelområdet, regnbågsfärgade bubbelpooler som förvandlas till matchande bubblor och stjärnor som rensar alla återstående bubblor och andra föremål.