O Shoot 2048 Hexa é um jogo de tiro interminável semelhante ao Hexa Shooter 2048, que inclui acções de fusão de peças e de atirador de bolhas. Contra painéis de madeira escura, o jogador dispara peças hexagonais numeradas contra células vazias em filas de favos de mel. Os seus objectivos são jogar o máximo de tempo possÃvel e obter a pontuação mais alta de sempre.
O jogador começa por disparar um projétil hexagonal contra uma das células. Se o projétil seguinte coincidir com a primeira peça, o jogador dirige-o para uma célula vazia adjacente à primeira. Os azulejos deslizam juntos e fundem-se automaticamente na última célula visada para formar um novo azulejo de número superior.
Quando o jogador usa células vazias especÃficas, o jogo deixa cair uma nova linha vazia. Com mais filas, o segundo projétil também pode deslizar para cima. Em alguns casos, o deslizamento para cima diminui o número de linhas. Três ou mais peças iguais podem também fundir-se quando estão em posições adjacentes. Dito isto, o número de uma nova peça só aumenta quando pares de peças iguais se fundem.
Se um projétil não coincidir, o jogador dispara-o para outro local para se preparar para uma futura fusão. Usa uma linha de mira pontilhada e uma ferramenta de mira para efetuar disparos precisos. Caso contrário, demasiadas linhas podem cair até que as células atinjam o atirador. Se isso acontecer, o jogador perde o jogo e tem de recomeçar para tentar ultrapassar a sua última melhor pontuação.
O Shoot 2048 Hexa tem um único impulsionador. No canto inferior direito, o jogador pode aceder a um martelo tipo malho que lhe permite remover qualquer peça selecionada. O jogador recebe três utilizações gratuitas e depois tem de ver anúncios para ganhar acesso adicional.
O jogo mostra a pontuação atual do jogador ao lado de uma estrela na área superior central. O jogador também pode acompanhar a sua pontuação de sempre na área superior direita.