O Mysterious Pirate Jewels 3 é um jogo de combinação de 3 com tempo e estilo de ligação que apresenta uma grelha de formas hexagonais. Ao longo de 45 nÃveis, o jogador liga e liberta jóias, também conhecidas como hexágonos, da grelha em grupos para quebrar e remover fundos coloridos. Os seus principais objectivos são ganhar pontos padrão e de bónus através de partidas antes que o tempo acabe e completar todos os nÃveis.
Em vez de usar um número limitado de linhas de ligação, o jogador liga três ou mais jóias iguais com setas da mesma cor em qualquer direção. Quando o jogador completa uma correspondência, o jogo faz com que os hexágonos correspondentes desapareçam em faÃscas e depois preenche os espaços vazios na grelha com novos hexágonos. Remove imediatamente qualquer cor de fundo cor-de-rosa da grelha. Com qualquer outra cor, como o azul, remove apenas a cor superior. O jogador tem de efetuar outra partida para remover o cor-de-rosa.
Mysterious Pirate Jewels 3 carrega vários boosters no canto inferior direito após a conclusão de cada partida. O jogador pode usar uma seta para trás para desfazer o seu último movimento. Com o tempo, o mesmo botão transforma-se em duas setas que baralham as peças. O jogador também pode arrastar um martelo para a grelha para libertar jóias que combinam e não combinam.
Durante o jogo, os espaços também são preenchidos com itens especiais, incluindo hexágonos ovais com as cores do arco-Ãris que agem como coringas para combinar com qualquer joia, uma bola oval brilhante de cor clara que age como um relâmpago para remover todos os hexágonos que combinam com sua cor e uma ampulheta que adiciona mais tempo ao relógio.
