Math Gardens é um jogo de puzzle e renovação de números. Uma rapariga da cidade chamada Emily precisa da ajuda do jogador para limpar e renovar um telhado e criar um jardim urbano. O jogador realiza cada renovação depois de ganhar estrelas suficientes ao resolver equações matemáticas.
Durante o jogo de matemática, o jogador recebe duas ou mais equações matemáticas sobrepostas numa disposição semelhante à s colunas e linhas de um jogo de palavras cruzadas. O jogo apresenta peças numeradas por baixo da área das equações. O jogador deve colocar estas peças nas posições corretas para completar as equações. Depois de terminar um nÃvel, o jogador recebe uma estrela.
O Math Gardens acaba por orientar o jogador a selecionar um botão de vaso de flores no canto inferior esquerdo do ecrã da cidade e a comprar um serviço de renovação com uma ou mais estrelas. Em seguida, ele executa ações de renovação automatizadas, como remover detritos e água parada do telhado, plantar videiras e outras plantas e flores, e construir um caminho de jardim.
Se o jogador ficar preso ao tentar resolver equações, pode usar as pedras preciosas que ganha no final de cada nÃvel para pagar ferramentas úteis. O botão da lupa revela um único número. O botão do alvo revela uma equação inteira.
Todos os dias, o jogo também pede ao jogador para atingir vários objectivos, como se pode ver quando o jogador seleciona um botão de selo dourado em forma de flor por cima do vaso de flores. Quando completam todos os objectivos de um dia, recebem recompensas de baús de tesouro.
O jogador também pode realizar missões mensais. Selecionam um botão de lista de verificação no canto superior esquerdo e jogam jogos diários de equações matemáticas para ganhar uma recompensa mensal.