Hexa Master 3D: Sort Puzzle é um jogo de ordenação com uma componente de construção. O jogador constrói belos cenários em pequenas ilhas flutuantes com peças de madeira coloridas em forma de hexágono, chamadas hexas, que recolhe através de acções de ordenação. Reorganiza pilhas de peças de cores diferentes numa grelha para criar novas pilhas que contenham peças da mesma cor.
O jogador recebe um conjunto de três pilhas de cada vez. Move as peças para espaços da grelha em posições que permitam que as peças do topo se virem automaticamente para peças da mesma cor no topo de pilhas adjacentes. Continuam a colocar as pilhas até recolherem peças suficientes, conforme determinado por um objetivo apresentado na área superior esquerda junto a uma peça com riscas de arco-Ãris.
Hexa Master 3D: Sort Puzzle oferece quatro boosters. O jogador pode usar um martelo para remover qualquer pilha, uma luva para trocar duas pilhas, setas duplas para baralhar pilhas não colocadas com outras novas e uma bomba para limpar uma pilha selecionada e outras num raio à sua volta. Eles também podem abrir mais espaços com visualizações de anúncios.
O componente de construção não envolve fusões num cenário de criação. Em vez disso, o jogador usa as peças coletadas para construir automaticamente os retiros da ilha flutuante. No momento da redação deste artigo, os retiros incluem o Pavilhão Real, o Jardim Zen, o Campo de Flores, a Cabana Sakura e a Casa dos Cogumelos. Os criadores do jogo acrescentam novos retiros de tempos a tempos.
O jogo também permite ao jogador desbloquear aleatoriamente novos fundos com moedas. O jogador ganha moedas adicionais vendo anúncios e coleccionando recompensas diárias e de tarefas, conquistas e arcas do tesouro.