Thread Sort Puzzle 3D is een sorteerpuzzel met objecten gemaakt van draden. Het doel van de speler is om deze objecten uit elkaar te halen door draden te trekken, te ontrafelen en te sorteren in vakjes met bijpassende kleuren. Dit spel komt het meest overeen met populaire spijker-, schroef- en andere hardwaresorteerspellen zoals Screw It!, Get a Screw: Puzzle! en Colors Pins.
Nadat de speler een kleur garen heeft gekozen, trekt het spel het garen automatisch uit het voorwerp en wikkelt het om een spoel in een bak. Als de kleur niet overeenkomt, wordt het garen in vijf gaten onder de containers gespoeld. Als de speler de vijfde spoel vult, verliest hij. Ze moeten dan een advertentie bekijken om verder te gaan of het level opnieuw te starten.
Anders gaat de speler door met dit proces totdat er geen draden meer over zijn. Het spel beloont ze met munten en ontgrendelt dan het volgende level en object. Op elk moment kan worden ingezoomd op een object met de zoomschuif rechtsonder.
Thread Sort Puzzle 3D laat de speler sneller werken door twee extra containers vrij te spelen als ze video`s bekijken. Ze krijgen ook drie boosters. De speler kan een gat toevoegen, een vak transformeren zodat het elke kleur accepteert en de draden uit alle gaten verwijderen.