Super Stacker 3 is een bouwsteenspel gebaseerd op de populaire Super Stacker-serie. Het bevat antropomorfe vormen (paarse dozen, gele cirkels en groene driehoeken) die een speler moet gebruiken, samen met kennis over bouwstenen, geometrie en natuurkunde, om ontwerpuitdagingen in 40 levels te voltooien. Ze kunnen een toren bouwen, poten voor een reus maken of een bouwwerk met een platte bovenkant maken.
De speler krijgt in elk level een bepaald aantal verschillende vormen die hij op een balk boven het speelveld bekijkt. Om te slagen hoeven ze alleen maar een gestapelde structuur te maken met de vormen die enigszins aan de uitdaging voldoet en minstens 10 seconden lang niet omvalt. Als de speler faalt, tonen de vormen negatieve emoties, zoals woede, bezorgdheid, angst en shock.
Super Stacker 3 is bijna identiek aan Super Stacker 2, behalve dat het meer dan 40 nieuwe uitdagingen en ontwerpmogelijkheden biedt. Het heeft ook geen stack editor voor het ontwerpen van nieuwe stapels. De gameplay is echter precies hetzelfde. De speler stapelt vormen in 10 levels per modus over vier modi gerangschikt van makkelijkste naar moeilijkste. In deze versie worden de modi "packs" genoemd (Pack 1, Pack 2, Pack 3 en Pack 4). Als de speler ze allemaal uitspeelt, kan hij ook een bonusmodus spelen.
