Shoot 2048 Hexa is een eindeloze samenvoegshooter die lijkt op Hexa Shooter 2048 en die zowel tegelsmelt- als bubbelshooter-acties bevat. Tegen donkerhouten panelen schiet de speler genummerde zeshoekige tegels naar lege cellen op honingraatrijen. Het doel is om zo lang mogelijk te spelen en de hoogste score aller tijden te halen.
De speler begint met het schieten van een hexa-projectiel op een van de cellen. Als het volgende projectiel overeenkomt met de eerste tegel, richt hij het op een lege cel naast de eerste. De tegels schuiven in elkaar en smelten automatisch samen op de laatste cel om een nieuwe tegel met een hoger nummer te vormen.
Als de speler bepaalde lege cellen gebruikt, wordt er een nieuwe lege rij geplaatst. Met extra rijen kan het tweede projectiel ook omhoog schuiven. In sommige gevallen vermindert het omhoog schuiven het aantal rijen. Drie of meer gelijke stenen kunnen ook samengevoegd worden als ze naast elkaar liggen. Dit gezegd hebbende, neemt het aantal nieuwe stenen alleen toe wanneer paren gelijke stenen samensmelten.
Als een projectiel niet past, schiet de speler het ergens anders heen om zich voor te bereiden op een toekomstige samensmelting. Ze gebruiken een stippellijn en een richtmiddel om nauwkeurig te kunnen schieten. Anders kunnen er te veel rijen naar beneden vallen totdat de cellen de schutter bereiken. Als dat gebeurt, verliest de speler het spel en moet hij opnieuw beginnen om te proberen zijn laatste beste score te overtreffen.
Shoot 2048 Hexa heeft één booster. In de rechterbenedenhoek heeft de speler toegang tot een hamer waarmee hij geselecteerde tegels kan verwijderen. Je kunt hem drie keer gratis gebruiken en daarna moet je advertenties bekijken om extra toegang te krijgen.
Het spel toont de huidige score van de speler naast een ster in het middenbovengebied. De speler kan ook zijn totaalscore bijhouden in het gebied rechtsboven.