Number Bubble Shooter is een bubbelshooter in 2048-stijl. De speler voert verschillende opdrachten uit en ontgrendelt nieuwe levels door genummerde projectielen samen te voegen met bijpassende hangende projectielen. Het spel behandelt de bubbels als doffe edelstenen. De bubbels met het hoogste nummer worden gepresenteerd in gouden vierpuntige zettingen.
Elk level heeft een verborgen doel voor de speler, zoals het veld helemaal leegmaken of een specifieke score verdienen. Het spel voorziet ze van een ringshooter en twee niet-verwisselbare projectielen om paren samen te voegen.
Hoewel de speler geen projectielen kan verwisselen, kan hij een booster rechtsonder gebruiken om een niet-matchend primair projectiel weg te gooien en te vervangen door het secundaire projectiel. Ze krijgen drie keer toegang en moeten dan advertenties bekijken om de booster te kunnen blijven gebruiken.
Number Bubble Shooter voegt een nieuwe rij bubbels toe aan het veld elke keer dat de speler er niet in slaagt een samenvoeging uit te voeren. Dit obstakel kan er al snel voor zorgen dat de bubbels in de slechtst mogelijke positie onder een blauwe horizontale laserlijn terechtkomen. Als dat gebeurt, wordt het spel helemaal teruggezet naar het begin in plaats van naar het begin van het huidige level.
De speler kan een totale herstart voorkomen door een secundaire booster te gebruiken in het gebied linksonder dat er in eerste instantie uitziet als het silhouet van een raket. Na elke samenvoeging kleurt het spel een klein deel van deze plek om de raket op te laden. Als deze booster beschikbaar is, vernietigt de speler de bubbels met een explosie.
