Noorderlicht: The Secret of the Forest is een samensmeltingspel met avontuur-, knutsel- en mysterie-elementen. Een jonge vrouw genaamd Marya en een wijze oudere kat hebben de hulp van de speler nodig om te ontdekken waarom het bos over het hele landschap is overwoekerd. Ook moeten ze achter het lot van de vorige bewoners zien te komen.
De speler moet het landschap vrijmaken van struikgewas en bomen, magische voorwerpen en waardevolle aanwijzingen blootleggen, ruwe en gefabriceerde materialen gebruiken om structuren te bouwen en te repareren, planten laten groeien, gewassen oogsten en de vermiste mensen opsporen. Ze moeten ook proberen zoveel mogelijk munten, smaragden, energiebollen, sleutels en sterren te verzamelen om verschillende opdrachten te voltooien.
Op een samenvoegraster op grondniveau verwerft de speler een grote verscheidenheid aan voorwerpen en voltooit hij projecten voornamelijk door drie of meer identieke basisstukken samen te voegen. Ze wisselen ook heel fruit en andere voorwerpen uit, gebruiken bijlen om bepaalde werkzaamheden uit te voeren, openen schatkisten en houten kratten en selecteren willekeurige zwevende wolken die zijn gemarkeerd met energiebouten en rode vraagtekens.
Noorderlicht: Het geheim van het woud toont het saldo van de valuta en de bijlen boven in het scherm. De speler kan meer verdienen als beloning via het blauw-met-gouden cadeauboek in het midden en het notitieblok voor de dagelijkse doelrealisatie. Ze kunnen de knutsel- en ontdekkingstochten volgen via het kaartpictogram.