Merge Squares is een samenvoegspel met 2048 en match-3. Op roosters van verschillende grootte voegt de speler rondhoekige genummerde vierkante tegels samen van niveau naar niveau.
Het spel bevat verschillende soorten uitdagingen die rechts van een trofee boven het raster worden weergegeven. Om een opdracht te voltooien, moet de speler ten minste drie identieke vierkante tegels samenvoegen om een tegel met een hoger nummer te maken (bijvoorbeeld drie vierkanten van 2 om een vierkant van 4 te maken of drie vierkanten van 8 om een vierkant van 16 te maken). Hun doel is om de vierkanten te laten evolueren tot een specifiek genummerd vierkant of om een specifieke score te verdienen. Van tijd tot tijd ontvangen ze een rode jokertegel die ze als joker kunnen gebruiken in plaats van een willekeurig genummerd vierkantje.
De speler moet voorzichtig zijn bij het plaatsen van vierkante tegels op een raster. Tijdens een samenvoeging komen alle vierkantjes samen om een hoger genummerd vierkant te maken op het laatst gebruikte veld. Als de speler een vierkant plaatst tussen een overeenkomend vierkant aan de ene kant en twee aangrenzende vierkanten aan de andere kant, worden ze alle vier samengevoegd. Bovendien, als de speler een derde vakje plaatst op een plek die niet naast een overeenkomend of hoger genummerd vakje ligt, kan het nieuwe vakje op een ongewenste plek ontstaan. Het spel blokkeert ook sommige velden met muren.
Toch krijgt de speler uiteindelijk boosters, in het spel bekend als aanwijzingen, die helpen. Ze krijgen bijvoorbeeld een swap-booster waarmee je twee willekeurige tegels kunt verwisselen en een bomb-booster waarmee je muren kunt laten ontploffen. Daarnaast evolueert het spel soms een of meer tegels naast een nieuw gecreëerde tegel.
Merge Squares biedt beloningen in de vorm van munten en geschenken. Om meer te winnen of cadeaus te openen, moet de speler advertenties bekijken. Met hun munten kunnen ze uiteindelijk de winkelknop gebruiken om de tegel te upgraden naar verschillende skinopties, zoals koperen en regenboogkaders en swirl- en bubbelpatronen.
