Merge Multiply Crush Balls is een samenvoegspel met pachinko- en steenbreekelementen. In verschillende levels upgradet de speler ballen, in het spel kogels genoemd, en kegels om scenario`s te creëren waarin de ballen gestapelde genummerde blokken breken. Het doel is om zo lang mogelijk munten te verdienen en upgrades uit te voeren.
De speler gebruikt een eerste bank met munten om upgrades voor kogels te kopen. De bovenste pinnen hebben een waarde van 1. De speler kan een extra 1 kopen, weergegeven door een gouden bal, en deze samenvoegen met een van de bestaande 1-pins om die pin een waarde van 2 te geven.
Als een kogel uit de pijp op de 2-pin valt en rondstuitert, neemt zijn aantal en slagkracht toe. Vervolgens slaat de kogel met dezelfde kracht in een doosje. Als een kogel van 1 bijvoorbeeld één keer op de 2-pin valt, valt hij op een doosje en slaat hij erop met een kracht van 3. Elke keer dat de kogel het doosje raakt, wordt de kracht van de kogel verhoogd. Elke keer dat de kogel de doos raakt, vermindert het cijfer op de doos met drie punten. Als de kogel twee keer tegen een 2 pin stuit, dan wordt zijn waarde 5 (d.w.z. 1 2 2) en vermindert het getal op het vakje met vijf punten. De waarde verandert op basis van het aantal stoten.
Merge Multiply Crush Balls laat vervolgens kogels vallen in gekleurde verticale vermenigvuldigingsgleuven die de muntwinsten van de speler tot vijf keer kunnen vermenigvuldigen. De munten worden vervolgens automatisch overgebracht naar de bank in de linkerbovenhoek.
Voordat de speler aan een nieuw level begint, kiest hij of zij het aantal kogels (d.w.z. het aantal kogels dat valt), het aantal kogels (d.w.z. het startnummer van elke kogel) of de snelheid van het schieten (d.w.z. de snelheid waarmee de kogel valt) willen opwaarderen. Ze kunnen slechts één van deze opties per level kiezen.