Hexa Sort Master is een logisch puzzelspel met sorteeropdrachten in verschillende levels. Tegen een blauwe achtergrond sorteert de speler stapels zeshoekige tegels met verschillende kleuren op roosters van grijze straatstenen in verschillende patronen. Het doel is om scoretaken te voltooien, munten te verdienen en opdrachten te voltooien.
Het spel vereist dat de speler drie stapels tegelijk sorteert op basis van kleur en een pictogram op de bovenkant van elke tegel. Tegelpictogrammen zijn onder andere wolken, druppels, vlammen, sleutels, schedels, sterren en zwaarden. De speler kan alleen lege paver-velden gebruiken om te sorteren. Ze verdienen punten als ze de tegels in stapels van voldoende hoogte hebben gesorteerd.
De speler sorteert door een stapel op een lege tegel te schuiven en vervolgens een andere stapel met een bijpassende kleur en icoon ernaast te schuiven. Het spel draait automatisch het bijpassende deel van de eerste stapel op de tweede. Als gekleurde tegels in het onderste, onbedekte deel van de stapel overeenkomen met aangrenzende stapels, worden deze tegels ook automatisch omgedraaid.
Als de speler geen ruimte meer heeft, biedt Hexa Sort Master hem toegang tot stapelverwijdering, herpositionering en schuifelboosters. Met hun muntwinsten kunnen ze na verloop van tijd meer boosters kopen.
Aan het einde van een level kan de speler een reclamevideo bekijken om extra munten te ontvangen. Ze ontvangen ook munten, hartlevens, oneindige hartlevens of boosters via dagelijkse cadeaus als ze een kalenderpictogram op het beginscherm gebruiken. Als ze bepaalde doelen halen, ontvangen ze extra beloningen in de quest popup die toegankelijk is via een scroll-pictogram op hetzelfde scherm.