Hexa Sort 3D is een logisch puzzelspel met unieke driedimensionale renovatie-elementen. In verschillende levels sorteert de speler stapels zeshoekige tegels, in het spel bekend als decks, op een grijs rooster van straatstenen tegen een lichtblauwe achtergrond. Het uiteindelijke doel is om genoeg gekleurde scherven te verdienen om kleuren toe te voegen aan donkergrijze driedimensionale structuren op het beginscherm. Hun secundaire doelen zijn het verdienen van munten, energieharten en prop boosters die verder spelen mogelijk maken.
De structuren draaien op tan platforms. Elke structuur vertegenwoordigt een verzameling historische monumenten in India, Frankrijk, Groot-Brittannië en Amerika. Het beginscherm bevat ook extra speelplezier met onder andere een roze spaarvarken, een draaiwiel en cadeautjes.
De speler kan geen gekleurde scherven voor de bouwwerken vrijspelen zonder de decks op elk level te sorteren. Ze moeten met sets van drie decks tegelijk werken. Ze beginnen met het schuiven van een stapel op een lege vloer naast een andere stapel met tegels met dezelfde kleur. Het spel schuift vervolgens automatisch een korte stapel gekleurde tegels op de aangrenzende tegels met dezelfde kleur. Ook worden onbedekte tegels die overeenkomen met aangrenzende tegels omgedraaid.
Met Hexa Sort 3D kan de speler prop boosters gebruiken om de decks te verwijderen, te schudden en te verplaatsen om ruimte vrij te maken op een raster. Ze kunnen boosters, pavers en winsten verdienen door video`s te bekijken.