Gem Twins is een vaardigheidspuzzelspel met klassieke arcade-graphics. Twee broers zijn op zoek naar avontuur en zweven door 27 levels met ondergrondse kamers. De broers zijn niet echt normaal. Ze kunnen zichzelf in edelstenen veranderen. Deze gave is voordelig. Het maakt het makkelijker voor ze om moeilijke gebieden te betreden en vallen en obstakels te omzeilen. Het doel van de speler is om hun acties zo te sturen dat ze elk bollendoel bereiken, zowel in de normale als in de speedrun-mode.
De speler kan elk van de tweelingen laten lopen en springen. Ze kunnen ook één broer tegelijk tijdelijk laten bevriezen op de grond of in de lucht. Met deze vaardigheid kunnen ze met één broer een smal platform maken en vervolgens de tweede broer de plek laten gebruiken als springpunt tegen hoge muren, verdiepingen en andere obstakels. Omdat ze een broeder midden in de sprong kunnen bevriezen, kunnen ze dit edelstenen platform boven de grond maken. Ze kunnen het maken op een of meer punten halverwege de zijkant van een muur.