Fruit Frenzy Bubbles is een bubbelspel met een fruitteeltthema. De speler probeert rijen fruit weg te spelen van verschillende landschappen en boerderijen overdag en `s nachts. Ze proberen ook een zo hoog mogelijke score te halen.
De speler kan alleen fruitbellen laten knappen in groepen van drie of meer dezelfde. Veel voorkomende fruitsoorten zijn appels, bosbessen, kersen, citroenen, pruimen en watermeloenen. Het spel biedt een katapultschutter in plaats van een klassieke pijl-, kanon- of ringschutter en één fruitprojectiel per schot. Er wordt ook een voorbeeld van het volgende beschikbare projectiel weergegeven.
De speler gebruikt een stippellijn om te richten op twee of meer aangrenzende fruitbellen. Als de speler schiet en klaar is met het maken van een groep, knallen de fruitbellen en vallen de niet-aangrenzende bubbels in een lawine. De miklijn is erg handig omdat sommige achtergronden kleuren hebben die te veel mengen met de fruitkleuren om nauwkeurig te kunnen schieten.
Fruit Frenzy Bubbles heeft geen andere klassieke obstakels of uitdagingen dan een straf voor een gemiste schot. Als de speler er niet in slaagt om op verschillende momenten achter elkaar groepen te maken, schuift hij een of meer rijen gemengd fruit op hun plaats aan de bovenkant van het scherm. Er is echter geen methode om dit proces bij te houden, zoals zilveren, grijze of witte bubbels met penalty-pass icoontjes. De speler kan op elk moment een willekeurige penalty krijgen.