Foxy Eco Sort is een educatief sorteerspel met een sterk recyclingthema en elementen uit reageerbuissorteer- en mysteriespellen. De speler helpt Foxy en haar vrienden en buren met het oprapen van afval dat hun bos en andere gebieden vervuilt. Ze proberen ook de verantwoordelijke persoon te vinden en kwade plannen te dwarsbomen om nog meer schade aan te richten.
De afvalcategorieën in de game zijn elektronica, glas, metaal, organisch afval, papier en plastic. Veelvoorkomende soorten afval uit deze categorieën zijn papieren producten zoals kartonnen dozen, cadeauzakjes, losse nieuwe kranten en oude gebundelde kranten. De speler sorteert ook plastic kinderspeelgoed, wegwerpbekers, gasblikjes, boodschappentassen en waterflessen.
De speler herschikt de items in containers die eruitzien als reageerbuizen. Ze kunnen de voorwerpen alleen sorteren in bakken of ruimtes met voldoende ruimte. Als ze een stapel van drie of meer van hetzelfde type maken, verandert de container in een realistische recyclebak.
Het spel beloont de speler aan het einde van elk level met groene bladpunten. Als de speler een advertentie bekijkt, verdient hij dubbele punten. Het verhaal vordert ook totdat er nieuwe aanwijzingen over het mysterie aan het licht komen.
Foxy Eco Sort heeft ook bonusboosters. De speler krijgt toegang tot extra containers die het sorteren makkelijker maken, een optie om zetten ongedaan te maken die sommige zetten terugdraait en andere handige hulpmiddelen zoals een belonend rad van fortuin. Ze moeten betalen om deze hulpmiddelen te gebruiken met bladpunten of advertentieweergaven.