Furry Furballs is een casual bubbelspel. In een magisch bos in een wereld vol bubbels moet de speler een aantal expressieve antropomorfe bontballen wegspelen die als bubbels knallen wanneer ze door projectielen worden geraakt. Het doel is om nauwkeurig te schieten, alle bontballen te laten knappen om nieuwe levels vrij te spelen, een hoge basisscore te verdienen en munten te verzamelen. Als ze verliezen, proberen ze hun laatste score te verbeteren.
In het spel krijgt de speler een begintegoed aan munten waarmee hij drie handige boosters kan kopen. De speler kan projectielkleuren verwisselen met een color swap booster, zijn basisscore verdubbelen met een multiplier booster en een hele horizontale rij verwijderen met een row-removal booster.
De speler kan alleen clusters van drie of meer gelijke, verbonden bontballen maken. Ze voltooien deze taak met een schutter, een laserlijn met dezelfde kleur en een richtbel. Ze krijgen het hoogste aantal punten als ze ononderbroken clusters knallen zonder onderbreking.
Furry Furballs heeft geen klassieke gemiste strafworpen. In plaats daarvan vallen er nieuwe rijen furball bubbels van verschillende kleuren op het veld nadat de speler een bepaald aantal keer heeft geschoten.