Fairy Sweet Balls is een bubbelspel. Fee Sofia heeft de hulp van de speler nodig om monsters in emoji-stijl te verslaan die door het hele land zoete lekkernijen hebben gestolen. De speler verzamelt de toetjes en snacks door de monsters met projectielen uit hangende rijen te slaan. Ze moeten in elk gebied een bepaald aantal lekkernijen verzamelen om de overwinning te behalen.
De speler ontvangt zes monsterprojectielen. Ze kunnen de projectielen niet verwisselen, maar de preview geeft ze de kans om een strategie van zes schoten te maken voordat ze de eerste gebruiken. Meestal verwijderen ze de rij projectielen door Sofia het hoofdprojectiel naar twee of meer bijpassende monsters te laten gooien die dicht bij elkaar liggen of over een kleine afstand. Soms kunnen ze vergelijkbare hoofden met verschillende emoties gebruiken om een cluster te vormen.
De monsterbellen vallen van de rijen en knallen. Niet-gelijksoortige bubbels die eraan vastzitten, knallen ook. In sommige levels wordt er echter geen cluster gevormd wanneer er een gat is. Bovendien raken sommige projectielen van monsterhoofden een verbonden groep gelijke ballen en stuiteren dan gewoon weg zonder waarschuwing. Projectielen stuiteren ook van desserts af.
Fairy Sweet Balls helpt de speler soms met verschillende krachtballen die een miklijn en richtpijl bieden. Deze bubbelhulpmiddelen zijn onder andere een zwarte bom die een grote niet-matchende cluster verwijdert, een wervelsnoepje dat meerdere doelen raakt via een stuiterbeweging en een regenboogbal die bij elk monsterkopje past.