Doodle Jump is een oneindige afstand, arcade platformer die een speler uitdaagt om een kleine alien vergelijkbaar met de klassieke Q*bert karakter te helpen springen zo hoog mogelijk op platforms opgehangen op een grafiek papier achtergrond. Platforms onder het personage verdwijnen als het hoger springt. Als de speler het personage van een platform laat vallen, kan hij het spel verliezen. Ze moeten dan weer van voren af aan beginnen.
De speler hoeft nooit tijd te verspillen met klikken of tikken om het personage te laten springen. De alien springt automatisch. De belangrijkste taak van de speler is om hem naar links of rechts te sturen om hem op een platform en uit de buurt van bedreigingen te houden. Obstakels zijn onder andere andere aliens en monsters en zwarte gaten. Sommige platforms breken, verdwijnen, exploderen of glijden weg.
Doodle Jump voorziet de speler van handige hulpmiddelen om de alien op het papier te houden, waaronder veren, trampolines, propellerdoppen en zelfs jetpacks. De alien kan projectielen uit zijn slurfachtige neus schieten. De speler kan hem ook van de linker- of rechterkant van de pagina sturen, zodat hij aan de andere kant op een hoger platform kan verschijnen.
De speler voltooit meer dan 100 missies en verdient beloningen en prestaties. De laatste omvatten prestaties voor het springen op meerdere opeenvolgende veren, het vermijden van conflicten en het overleven van een buitenaardse ontvoering. De speler kan meerdere keren opnieuw proberen om zijn eigen beste score te overtreffen of een toppositie op een leaderboard te behalen.