Destroy Base is een schietspel dat zich richt op militaire gevechten tegen terroristen en gijzelnemers vanuit een helikopter- of vluchtperspectief tijdens verschillende weers- en gevechtsscenario`s. De speler schakelt vijanden uit, vernietigt gebouwen en redt gijzelaars. In deze hidden-view first-person-shooter worden de avatar van de speler en zijn wapen niet op het scherm getoond. In plaats daarvan is het zicht een cameraperspectief van het doelgebied op een rooster onder de verborgen shooter.
De speler krijgt aanvankelijk een 9 mm pistool. Na een succesvolle missie krijgen ze geld om hun pistool te upgraden. Upgrade-opties zijn onder andere een 9 mm Killer Gun, 4,6 mm Rapid - Fire, 5,56 mm Assault Rifle, 5,56 mm M614, 7,62 mm Destroyer, 7,62 mm Exterminator en Null Burning Blaster. Ze kunnen het geldbedrag dat ze aan het einde van een missie ontvangen verdrievoudigen met een X3 vermenigvuldiger als ze een advertentie bekijken.
Destroy Base vereist niet dat de speler de hele basis vernietigt. Het spel toont doelen, zoals een bepaald aantal vijandelijke soldaten of bijbehorende machines, als pictogrammen in de linkerbovenhoek. Het biedt ook verschillende nuttige voorwerpen, waaronder rode vaten die de speler kan gebruiken om de vijand op te blazen. Een schademeter bovenaan het scherm geeft met een rode balk aan hoeveel gezondheid de speler nog heeft tijdens een bepaalde missie.
