Connect Dots 2 is een puzzelgame die de speler uitdaagt witte lijnen te trekken tussen blauwgrijze stippen op patronen die vrij zweven voor een bewegend sterrenveld in drie werelden en 16 levels per wereld. De speler kan alleen nieuwe levels en werelden bereiken door ze in opeenvolgende volgorde vrij te spelen.
De speler moet deze taak uitvoeren zonder lijnen te trekken die hij eerder tussen de stippen heeft getrokken. In elk level staan de tijd-, level- en wereldnummers boven de lijnen en stippen. De patronen op het veld worden gemaakt met verschillende vormen, waaronder rechthoeken, vierkanten en driehoeken.
Zodra de speler een stip selecteert, geeft Connect Dots 2 een gele pijl om hem te helpen naar de volgende stip te gaan. Nadat ze een sectie hebben overgetrokken, wordt de lijn turquoise om te laten zien wat ze hebben gedaan. Als de speler onbedoeld een stuk volgt, kan hij opnieuw beginnen door alles weg te zappen met een gele laser die verschijnt als hij de knop met de dubbele pijl selecteert.