Color Yarn Sort is een sorteerspel dat overeenkomsten vertoont met hardware- en parkeersorteerspellen. Het is de taak van de speler om gekleurd garen op houten spoelen over te brengen in mandjes met bijpassende kleuren in verschillende levels. Ze verdienen gouden munten voor hun inspanningen.
De speler vraagt het spel om een transfer uit te voeren door een mand in een optimale positie te plaatsen. Elk level toont de garenklossen op verticale transportbanden boven in het scherm, vijf lege productieruimtes in het midden en een mix van mandjes in een bak onder de ruimtes. In de meeste levels worden sommige mandjes in de lade gedrukt. De speler moet een bepaald aantal andere manden gebruiken voordat er een niet-beschikbare mand opduikt.
Gezien het beperkte aantal vakjes moet de speler de mandjes zorgvuldig selecteren zodat ze passen bij de garenkleuren die het dichtst bij de onderkant van de transportbanden staan. Tijdens het verplaatsen houdt het spel op een horizontale voortgangsbalk bij hoeveel ruimte er nog in een mandje over is. Een volle mand wordt afgesloten met een plastic deksel voordat de mand van het scherm verdwijnt.
Color Yarn Sort biedt drie boosters onder het overdrachtsgebied die op specifieke momenten vrijkomen. Met de eerste kan de speler garen automatisch overbrengen van een willekeurige spoel naar een mandje. Met de tweede kun je een niet-beschikbaar inzetmandje selecteren en gebruiken. Tot slot kunnen ze willekeurig een aantal garenklossen schudden.