Color Water Sort 3D is een driedimensionale versie van populaire klassieke sorteerspellen waarbij een speler banden van verschillende kleuren water in aparte reageerbuizen en andere containers moet sorteren. In deze versie moet de speler ook snel genoeg spelen om drie gouden sterren te verdienen.
Door de levels heen sorteert de speler de gekleurde stroken water. Als ze een reageerbuis vullen met één kleur, wordt deze afgesloten met een stop en schieten er confetti op het scherm. Als ze een level uitspelen, krijgen ze sterren en gouden munten. Ze kunnen hun muntwinsten vermenigvuldigen door een pijl te stoppen op een X2 tot X5 vermenigvuldigingsmeter. Ze kunnen ook munten winnen door een spaarvarken te openen en een draaiwiel op het beginscherm te laten draaien, een progressiebeloningscadeaubox te accepteren en sleutels te verzamelen om schatkisten te openen.
Als de speler een fout maakt, kan hij de terugpijlknop rechtsboven op de horizontale voortgangsbalk met sterren gebruiken. Als ze een extra reageerbuisje moeten toevoegen, kunnen ze de knop Toevoegen linksboven op de balk gebruiken. In het spel kunnen ze ook een hint bekijken met de vergrootglasknop in de rechterbovenhoek of een level helemaal overslaan met de pijltjesknop in de linkerbovenhoek onder de homeknop.
In Color Water Sort 3D kan de speler zijn ervaring aanpassen met de munten die hij wint. Ze kunnen de munten gebruiken om willekeurige nieuwe reageerbuisvormen, achtergronden en stoppen vrij te spelen.
