Color Block Jam is een blokpuzzelspel met een tijdslimiet, vergelijkbaar met het sorteren van parkeerterreinen en motorvoertuigen. In verschillende levels moet de speler polyomino-vormen verwijderen van borden met verschillende vormen en groottes. Als ze een nieuw level ontgrendelen, krijgen ze munten die ze kunnen verdubbelen door advertenties te bekijken.
De speler moet de stukken een voor een door kleur-gematchte versnipperaars schuiven die de vormen in afzonderlijke blokjes breken. Een bord kan twee of meer van deze shredders hebben langs de randen. Sommige borden hebben meerdere shredders van verschillende breedtes. De speler kan alleen een vorm versnipperen met een bijpassende versnipperaar van dezelfde breedte of breder. Bij sommige levels kan de speler een vorm alleen in de richting van een pijl schuiven.
Color Block Jam biedt veel uitdagende speelmogelijkheden. Sommige borden hebben bijvoorbeeld openingen die niet bespeelbaar zijn. Bovendien moet de speler de vormen in een bepaalde sorteervolgorde plaatsen of de basis van een stapel vormen verbrijzelen voordat hij andere vormen van de stapel verbrijzelt. Het spel biedt echter boosters op niveau 8, 12 en 16, waaronder een sneeuwvlok die de timer 10 seconden laat bevriezen, een hamer die een enkele vorm van het bord verwijdert en een kleurenstofzuiger die alle blokken van één kleur verwijdert.
