Coffee Sort Puzzle is een drank sorteerspel. Het is vergelijkbaar met hardware- en parkeersorteerspellen. In een koffiewinkeltje moet de speler verschillende soorten dranken sorteren, verpakken en serveren.
Bekers gevuld met drank gaan op een lopende band naar de boksruimte. Veel voorkomende smaken zijn koffie, kers, druif, munt en sinaasappel. De speler stuurt maximaal vier dragers met dezelfde kleur tegelijk naar de ruimtes onder de apparatuur. Deze actie zorgt ervoor dat het spel de drankjes overbrengt naar de dragers en vervolgens de producten verpakt en serveert. Als de speler bereid is om advertenties te bekijken, kan hij drie extra velden openen en sneller werken. Als ze een level voltooien, ontvangen ze muntloon.
Coffee Sort Puzzle compliceert het boksproces op verschillende manieren. Het legt bijvoorbeeld de drankhouders op een stapel, waardoor de speler gedwongen wordt om alle houders met dezelfde kleur te deblokkeren die ze nodig hebben voor specifieke drankjes. Bovendien worden soms nieuwe houders aan de stapel toegevoegd vanuit genummerde opslagruimten.
Het spel probeert de speler te helpen door een bord weer te geven boven de drie vergrendelde vakjes waarop het aantal kopjes staat dat nog in een vakje gezet en geserveerd moet worden in een level. De speler krijgt ook drie handige hulpmiddelen wanneer hij niveau 5, 10 en 15 bereikt. Met het eerste hulpmiddel kunnen ze bijvoorbeeld maximaal drie keer extra ruimtes vrijspelen. Als ze deze toegang hebben opgebruikt, moeten ze verdere toegang kopen met hun munten of advertentieweergaven.