Butterfly Kyodai Deluxe 2 is een bijpassend spel in connect-stijl dat gebruikmaakt van vlindervleugels in plaats van traditionele afbeeldingen en tegels. In een vredige zomerse omgeving moet de speler paren vlindervleugels aan elkaar koppelen om vlinders te maken op een tweekleurig grijs dambord.
Hoewel het spel bestaat uit eenvoudige klik-tik-bewegingen om paren te selecteren, biedt het spel veel uitdagingen. De speler kan alleen paren maken van vleugels die naast elkaar, op elkaar en aan de rand liggen, of vleugels die over een opening langs de randen of over het hele bord liggen met niet meer dan twee hoeken van 90 graden of drie witte, groenomrande lijnen. Ze moeten het bord leegspelen voordat de tijd op een blauwe horizontale timerbalk is verstreken.
Het spel maakt het spel ook moeilijk door een aantal vleugels met vergelijkbare kleuren en patronen te presenteren. Het produceert een uitbarsting van witte sterren in het kielzog van elke vlinder die van het scherm wegvliegt. Deze sterren verdwijnen niet snel genoeg. In plaats daarvan blokkeren de sterren het bord een beetje. Na verloop van tijd verhoogt het spel het aantal en het soort uitdagingen. De speler moet bijvoorbeeld wedstrijden spelen waarbij een of meer randen van het bord worden geblokkeerd door struiken.
Butterfly Kyodai Deluxe 2 biedt de speler verschillende hulpmiddelen, waaronder bevriezen, hint en schuifelen. Met de bevriestoets voor sneeuwvlokjes kan de timer een paar seconden worden bevroren. Met de hintknop laat het spel de vakjes achter een bijpassend paar knipperen met een witte gloed. Met de schuifelknop worden de vleugels op het bord herschikt, waardoor er meer naast elkaar en gestapelde combinaties ontstaan.
Als de toegang tot boosters is afgelopen, kan de speler extra toegang krijgen door dagelijkse beloningspakketten te openen via de knop Ringkalender op het beginscherm of door reclamevideo`s te bekijken.
De speler kan ook de vleugels en achtergrond achter het bord veranderen met munten die hij na elk spel wint. Ze kunnen extra munten verdienen door advertenties te bekijken.