Bubble Shooter Ultimate is een bubbelspel. Tegen een eenvoudige achtergrond beweegt de speler zich van level naar level door een mix van gekleurde bubbels van een speelveld te verwijderen. Het uiteindelijke doel is om een zo hoog mogelijke score te behalen.
De speler krijgt een ringshooter, twee verwisselbare projectielen en een korte stippellijn met een pijlpunt. Ze kunnen alleen bellen verwijderen door met de projectielen clusters van drie of meer bij elkaar horende bellen te maken. Als een cluster bubbels knalt, beloont het spel de speler met punten. Als de speler geen cluster maakt, verliest hij een van de vijf zilveren penalty-pass bubbels in het gebied linksonder. Als de speler vijf penalty`s maakt, wordt hij gestraft met een extra rij bubbels.
Bubble Shooter Ultimate biedt ook power-ups. Als de speler genoeg bubbels laat knappen om een nieuw level te bereiken, geeft het spel hem de mogelijkheid om een power-up te kiezen. Je kunt bijvoorbeeld een extra projectiel aan de ring toevoegen, zodat je drie verwisselbare projectielen per schot kunt gebruiken. Ze kunnen ook een van de drie standaard boosters kiezen (bommen, regenboogballen en raketten), de lengte van de miklijn met 25% vergroten of hun kans op een bepaald type booster vergroten.
De speler kan zijn score bijhouden onder een medaillepictogram rechts van het speelveld. Ze kunnen hun beste score aller tijden bijhouden onder een trofee-icoon.