Bubble Shooter: Pop Adventure is een bubbelspel. Tegen een ruig landschap onder een blauwpaarse nachthemel met sterren voltooit de speler opdrachten terwijl hij een kronkelige weg door de lucht aflegt door hangende patronen van gemengd gekleurde bellen te knallen. Het doel is om genoeg punten te verdienen om drie gouden sterren per level en munten te verzamelen met een beperkt aantal zetten.
De speler knalt de bubbels met een verwisselbaar projectiel op een gloeiend witte, roterende ringschieter die is voorzien van een laserrichtlijn met bijpassende kleur en een richtbel. Ze moeten ten minste twee dezelfde bubbels raken met het projectiel om een cluster van drie of meer te maken. De bellen knallen bij de inslag. Als er niet-passende bubbels met het cluster zijn verbonden, vallen deze naar de bodem van het veld en knallen ze.
Het spel biedt speciale bubbels en boosters. De speler kan een gidsknop op het beginscherm gebruiken om informatie over de speciale bubbels te krijgen. In een patroon kunnen ze bijvoorbeeld kleine bombellen, laserbellen en zelfs mysteriebellen tegenkomen. Met boosters moeten ze zes boosters opladen, waaronder een grote bom en een raket, door specifieke opdrachten op het speelveld uit te voeren.
Bubble Shooter: Pop Adventure gebruikt een bepaald aantal verzamelde sterren om de speler te belonen via een schatkist. De speler krijgt ook beloningen in de vorm van munten voor het uitvoeren van opdrachten, zoals het laten knappen van een bepaald aantal bellen of het verzamelen van een bepaald aantal sterren.