Bubble Shooter: Aquarium is een bubbelspel. In vijf levels gebruikt de speler een zeldzame spinner shooter om hangende rijen bubbels met kleurrijke vissen te laten knappen. Het doel is om alle bubbels weg te knallen en de hoogste level- en spinner-scores te halen.
Het spel toont de hangende rijen in het midden van het scherm en de shooter met maximaal drie verwisselbare visbellenprojectielen. De speler kan elk van de projectielen gebruiken door de witte dubbele pijlen tegen het groene midden van de spinner te selecteren.
Linksboven in het scherm zie je een aquarium in grijstinten onder een prestigescoreteller. Als de speler opeenvolgende schoten maakt die clusters van drie of meer bubbels met dezelfde kleur voltooien, voegt het spel een klein beetje kleur toe aan het aquarium. De speler ontvangt de spinnerbonus als hij het aquarium helemaal inkleurt.
Bubble Shooter: Aquarium biedt strafpassen in het gebied linksonder. Als de speler er niet in slaagt bubbels te laten knappen, verlaagt het spel een getal boven een pijl omlaag totdat het nul is. Er wordt dan een nieuwe rij neergezet.
De vissen zorgen vaak voor afleiding door in de bubbels te zwemmen. Hierdoor helpen de passen de speler om het aantal strafworpen voor gemiste treffers te verminderen.
