Bubble Mania Pirates is een eenvoudig bubbelschietspel met 30 levels met een high-seas en island-adventure thema. Het enige doel van de speler is om zoveel mogelijk bubbels te laten knappen als nodig is om een bepaald aantal gouden munten per level te verzamelen.
De speler moet een projectiel op twee of meer bubbels van dezelfde kleur schieten om bubbels van het speelveld te verwijderen en de munten te bereiken. Ze krijgen elk level een beperkt aantal projectielen. Zoals veel vergelijkbare spellen gebruiken ze een gestippelde richtlijn en een ringschieter die geladen is met twee projectielen. Ze kunnen op elk moment het eerste projectiel verwisselen met het tweede om de beste match te maken. Als ze nauwkeurig schieten, laten ze de bijbehorende belletjes knappen. Ze laten ook alle bubbels en niet te raken vaten en rotsen eronder los in watervaten op de bodem van het veld om extra punten te genereren. Als de speler een level wint, ontvangt hij punten en maximaal drie gouden sterren.
Bubble Mania Pirates biedt verschillende extra leuke manieren om bubbels te laten knallen. De speler kan door bevroren bellen schieten. Het spel bevat ook boosters. De speler hoeft echter geen power-ups te kopen. In plaats daarvan worden de boosters verspreid over elk level, en de speler verzamelt de krachtige hulpmiddelen bij het knallen van bubbels. De boosters omvatten regenboogbellen die bij elke kleur bellen passen, bommenbellen die nabije bellen doen ontploffen, bliksembellen die een horizontale rij bellen wegvagen en sleutelbellen die kettingen rond bellen ontgrendelen.