Bubble Birds is een bubbelspel met een reddingsthema. Op een tropisch eiland probeert de speler babyvogels te bevrijden uit hangende rijen, vaak in level te stijgen en een hoge score te halen.
Verschillende soorten vogels bezoeken het eiland, waaronder bluebirds, kardinalen, kolibries, papegaaien en spechten. Op een rokerig paneel gebruikt de speler de bubble shooter-actie om de babyvogels terug te brengen naar hun ouders. Het spel voorziet ze van een niet-traditionele shooter in de vorm van een nestje van twijgen dat op een met zeewier bedekte steen rust.
De speler krijgt één babyvogel tegelijk in het nest. Ze schieten een broedsel op twee of meer bij elkaar horende exemplaren om een legsel of groep te maken. Als ze een accuraat schot lossen, komt er rook op het scherm en verdwijnen de baby`s met een flits van veren. Niet bij elkaar horende jongen die aan de groep vastzitten, vallen van de onderkant van het scherm.
Bubble Birds laat na verloop van tijd willekeurig nieuwe rijen broedsels op het paneel vallen. De speler krijgt geen waarschuwing vooraf. Er volgen straffen als ze een bepaald aantal opeenvolgende schoten niet maken. Ze krijgen punten voor standaard treffers en combo streaks.
Dit spel bevat ook een aantal eigenzinnige, willekeurige uitdagingen of glitches. Als de speler een schot lost op een zijmuur, kan het vogelprojectiel van positie wisselen met een vogel die al in de rij staat. Als je een enkele vogel raakt, telt het spel de treffer als een groep van drie vogels. Tot slot knallen sommige projectielen als ze tegen de zijmuren botsen.
