Bob the Robber 3 brengt de inbreker met een hart terug om misdaad met misdaad te bestrijden in het derde deel van de populaire arcadepuzzelplatformerserie. De Top Secret Service heeft Bob`s hulp nodig bij het terugvinden van documenten uit het laboratorium van een gestoorde wetenschapper. Bob moet met een parachute naar een vreemde locatie en door de verschillende niveaus van de basis sluipen om zijn missie te voltooien.
Net als in de andere spellen uit de serie regisseert de speler de acties van Bob. Hij moet stilstaan in de schaduw om zich te verbergen voor camera`s en gewapende speciale bewakers; gewone bewakers en wetenschappers van achteren uitschakelen; draden doorknippen om beveiligingssystemen uit te schakelen; handige gadgets en codes op computers vinden; hangsloten en elektronisch vergrendelde deuren ontgrendelen; knock-out geslagen mensen verbergen achter grote kartonnen dozen; en de locaties van de topgeheime documenten ontdekken.
Bob the Robber 3 bevat geen systeem om geld te bemachtigen. Je kunt ook geen gadgets kopen. Zombies bestaan niet. In plaats daarvan speelt alles zich af op verschillende niveaus in afzonderlijke gebieden van de faciliteit. Bovendien nemen in linnen gewikkelde mummies de plaats in van zombies. Net als bij de standaard bewakers en wetenschappers moet de speler Bob de opdracht geven om ze van achteren te raken. Ook vindt de eerste training van Bob plaats in het eerste gebied van de faciliteit in plaats van in zijn huis of persoonlijke trainingsmagazijn.
