Animalon: Epic Monster Battle is een turn-based battle-arena spel vergelijkbaar met Digimon en Pokémon. De speler, als een jongen of meisje avatar, traint een verscheidenheid aan magische fantasiedieren voor de strijd terwijl hij door een divers landschap reist in 20 levels. Het personage begint zijn reis naar de overwinning in de strijd op een eiland met bossen en heuvels, een stad en een vuurtoren. Hun droom om het machtigste dierenteam te creëren brengt hen naar hoge bergtoppen, ijskoude gebieden en een actieve vulkaan.
De spelmechanismen zijn deels gebaseerd op toeval. Tijdens een gevecht moet de speler een categorie selecteren en vervolgens een gokkast de uiteindelijke beslissing laten nemen over het volgende actiemoment. De gokkast heeft drie knoppen. Met de eerste knop selecteert de speler zijn dierenteam. Met de tweede knop selecteren ze magische gereedschappen, aanvallen en verdedigingen. Tot slot kunnen ze het team van hun tegenstander bestoken met speciale aanvallen die uit de lucht komen vallen.
Animalon: Epic Monster Battle beloont de speler met punten, gouden sterren en gloeiende kracht waarmee de dieren in hun team, magische gereedschappen, aanvallen en verdedigingen, en speciale aanvallen worden opgewaardeerd. Zelfs als de speler een gevecht verliest, krijgt hij nog steeds de kracht om de categorieën die hij in zijn laatste gevecht heeft gebruikt te levelen.