2048 Cube Merge is een samenvoegspel dat 2048 combineert met bowlen en samenvoegmechanismen. Op een lang speelbord in de vorm van een steeg stuurt de speler gekleurde genummerde kubussen van de ene kant van de baan naar kubussen aan de andere kant om overeenkomende paren samen te voegen. Met elke samensmelting verdienen ze punten. Uiteindelijk winnen ze ook munten, die ze in de winkel van het spel kunnen gebruiken om de kleur van de wanden en de achtergrond van het bord te veranderen.
Om een projectiel kubus naar voren te laten schieten op de baan en samen te voegen met zijn gelijke, schuift de speler het naar links of rechts of dubbel-selecteert het. Als bijvoorbeeld een gele 2-kubus een andere 2-kubus raakt, ontstaat er een donkerblauwe 4-kubus. De kracht van een samensmelting zorgt ervoor dat de nieuw ontwikkelde kubus rondstuitert en soms automatisch samensmelt met een nabijgelegen gelijke.
De speler kan ook kubussen samenvoegen die zich al op de baan bevinden door een projectiel te richten op een niet-matchende kubus en deze in zijn match te duwen. Als ze een kubus met een hoger nummer ontgrendelen, zoals een 32- of 64-blokje, ontvangen ze munten en boosterbeloningen. Ze kunnen de munten verdubbelen door een reclamevideo te bekijken.
2048 Cube Merge biedt drie boosters in het midden onderaan het scherm, waaronder een regenboogkubus die met elke kubus overeenkomt en een zwarte bomkubus die elke kubus vernietigt. Het spel biedt ook spelupgrades. Als de speler bijvoorbeeld genoeg munten heeft, kan hij het voorkomen van de regenboogkubus, het aantal startblokken en de straal van de bom upgraden. Ze kunnen zelfs toegang kopen tot een voorbeeldbalk die de volgende beschikbare projectielen weergeeft.
